Der Zuständigkeitsbereich der Autobahnpolizei Holzkirchen umfasst die BAB A 8/Ost von München - Ramersdorf (ca. 42 km Länge) bis zur Anschlußstelle Irschenberg und auf der BAB A 995 (B 13 neu) von München Giesing bis zur Einmündung am Autobahnkreuz München Süd (ca. 12 km Länge) in die A 8/Ost.

Auf den Autobahnen im Landkreis München nimmt die Autobahnpolizei Holzkirchen die verkehrspolizeilichen Aufgaben, wie Verkehrsunfallaufnahme, die technische Verkehrsüberwachung und die Überwachung des Schwerverkehrs wahr. Einschließlich der Autobahnrastanlagen Holzkirchen Süd und Nord sowie Seehamer See ist sie neben den verkehrspolizeilichen auch mit den allgemeinpolizeilichen Aufgaben einer Polizeiinspektion betraut.

Erweiterte Zuständigkeiten der APS Holzkirchen liegen in den Bereichen der technischen Verkehrsüberwachung und der Unfallfluchtfahndung im Landkreis Miesbach.